胃食管反流是指胃内容物反流入食管，引起不适症状和( 或) 并发症的一种疾病，肥胖也是这种疾病的因素之一。而由于现在缩胃术在治疗病态性肥胖、糖尿病等方面被广泛运用，它与胃反流的关系也逐渐被大家所重视。
其实很多肥胖者在进行减重手术之前都会存在食管生理功能紊乱及解剖结构的异常，而这是导致胃食管反流的重要因素。同时，BMI较高的患者由于体重过高导梦到房子着火致胃食管内压力增高，也可以诱发胃食管反流症状。如果在这种情况下，患者进行了缩胃术则有可能会进一步导致胃食管内压力变大，从而出现胃反流现象。
佑道医生集团减重代谢专家吴良平教授指出，进行缩胃术后出现胃反流症状的患者其实很多都是跟患者自身有关。除一部分在手术之前就已经发生胃反流的患者之外，那些有体重过重、内脏脂肪过多导致各处器官压力过大等问题的患者在做完缩胃术后都是比较有可能发生胃反流现象的，但从某种程度上，这并非缩胃术所导致，而是患者本来就有这种隐患，通过缩胃术将这个问题了出来。但只要经过细心调理，这种现象很快就可以消除。
除患者自身隐患之外，缩胃术手术的主刀医生技术也会影响胃反流出现的概率。如果主刀医生技术和经验不足，则有可能会由于在手术时没有把握好而发生胃反流等并发症，而这种导致的胃反流则可能需要通过修正手术来治疗，不但增加了风险，也增加了时间、等方面的投入。